Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX1-2Q9UD57 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX1-2Q9UD57 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms