Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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