Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHPF2Q9P2E5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms