Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC180Q9P1Z9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms