Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHRF1Q9P1Y6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms