Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GDE1Q9NZC3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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