Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms