Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CMC2Q9NRP2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms