Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASS4Q9NQ75 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASS4Q9NQ75 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms