Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA4BQ9NPR2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4BQ9NPR2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms