Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LINC00597Q9H2U6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00597Q9H2U6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms