Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF541Q9H0D2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms