Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP1Q9C000 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms