Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF17Q9BXT8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF17Q9BXT8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms