Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNG6Q9BXT2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms