Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS2Q9BXC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS2Q9BXC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms