Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC28BQ9BUN5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms