Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms