Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2Q96Q42 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms