Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms