Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms