Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms