Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SHDQ96IW2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHDQ96IW2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms