Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTV1Q96GA3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms