Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEIL2Q969S2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms