Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms