Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TOPBP1Q92547 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOPBP1Q92547 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms