Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF4Q8WXU2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms