Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN9Q8WX39 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LCN9Q8WX39 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LCN9Q8WX39 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LCN9Q8WX39 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms