Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms