Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC197Q8NCU1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC197Q8NCU1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms