Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HJURPQ8NCD3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms