Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms