Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVBPQ8N300 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SVBPQ8N300 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SVBPQ8N300 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SVBPQ8N300 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVBPQ8N300 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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