Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VWDEQ8N2E2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms