Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL34Q8N239 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL34Q8N239 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms