Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM48Q8IWZ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms