Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP1Q86WV1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP1Q86WV1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms