Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT28Q7Z3Y7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms