Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APTXQ7Z2E3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms