Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCQ7RTU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms