Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms