Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HECW1Q76N89 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms