Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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