Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM43BQ6ZT52 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms