Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED9Q6R2W3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms