Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms