Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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MED27Q6P2C8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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MED27Q6P2C8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED27Q6P2C8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED27Q6P2C8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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