Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C9orf84Q5VXU9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C9orf84Q5VXU9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms