Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRPF38BQ5VTL8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms